ビルドした 13.1R のベースパッケージをインストールしようとするとエラーが出てインストールができない問題が発生。
pkg install -r FreeBSD-base -g 'FreeBSD-*' Updating FreeBSD-base repository catalogue... FreeBSD-base repository is up to date. All repositories are up to date. pkg: FreeBSD-liby-dev has a missing dependency: FreeBSD-liby
調べてみるとパッケージ作成のバグらしい。
早速 main では修正されているようです。
https://cgit.freebsd.org/src/commit/?id=1e9c9ab5957795acc0d436ce21ad07373081d990
13.1R に手動でこのパッチを適用してパッケージを作り直すとインストールできました。